O padrão oceânico e atmosférico associado ao fenômeno La Niña continuou presente no mês de junho. A temperatura da superfície do mar continuou abaixo da média histórica nos setores equatoriais do Oceano Pacífico. Já os valores de TSM, na região da Indonésia, variaram de normais a ligeiramente acima da média e a convecção esteve acima da média.

Na Região Norte, destacaram-se valores de anomalias positivas de precipitação em Roraima, asssociadas ao posicionamento favorável da ZCIT. Na Região Nordeste, a atuação de Distúrbios de Leste, e Vórtices Clônicos em Altos Níveis foram os principais responsáveis pelas anomalias positivas de chuvas no extremo leste. A atuação dos vórtices ciclônicos em altos níveis e alguns sistemas frontais tambem contribuíram para as anomalias positivas de precipitação no Rio Grande do Sul. A corrente de jato subtropical esteve bem ativa e atuou 25 vezes sobre o continente sul-americano.